Browse

You are looking at 1 - 10 of 564 items for :

  • Biology and Life Sciences x
  • Refine by Access: Content accessible to me x
Clear All

Abstract

In this study, matrix-assisted laser desorption ionisation time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) was used to identify bacteria from environmental matrices. The aim of this work was to determine the efficacy of this rapid technique and the bacterial community of agricultural samples. Environmental samples included the collection of irrigation waters and manures, and bacteria from the surface of vegetables were also investigated. From food safety point of view, the investigation of these microbial communities is inevitable considering their potential hazardous impact on the food production chain. Altogether 235 bacterial isolates were identified with the most frequent genera being Pseudomonas, Bacillus, Acinetobacter and Aeromonas. Our results indicated that MALDI-TOF MS can be used to identify causative agents of foodborne illnesses, food spoilage and common plant pathogens. However, limitations of the rapid identification technique were also encountered as we obtained correct identification at species level for 30.2% and at genus level for 69.8% of the isolates.

Open access
European Journal of Microbiology and Immunology
Authors:
Fadime Ersoy Dursun
,
Yasemin Çağ
,
Ender İğneci
,
Burcu Işık Gören
,
Ferhat Arslan
,
Tülin Akarsu Ayazoğlu
,
Ferruh Kemal İşman
, and
Mustafa Haluk Vahaboğlu

Abstract

Introduction

The presentation of the course of COVID-19-related T-cell responses in the first week of the disease may be a more specific period for adaptive immune response assessment. This study aimed to clarify the relationship between changes in peripheral blood lymphocyte counts and death in patients with COVID-19 pneumonia.

Methods

Thirty-three patients (14 females and 19 males) admitted for severe and desaturated COVID-19 pneumonia confirmed by polymerase chain reaction were included. Lymphocyte subsets and CD4+/CD8+ and CD16+/CD56+ rates were measured using flow cytometry from peripheral blood at admission and on the day of death or hospital discharge.

Results

Twenty-eight patients survived and five died. On the day of admission, the CD4+ cell count was significantly higher and the saturation of O2 was significantly lower in the deceased patients compared to the survivors (P < 0.05). The CD16+/CD56+ rate was significantly lower on the day of death in the deceased patients than in discharge day for the survivors (P = 0.013).

Conclusion

CD4+ lymphocyte percentages and O2 saturation in samples taken on the day of admission to the hospital and CD16+/CD56+ ratios taken at the time of discharge from the hospital were found to be associated with the mortality in patients with severe COVID-19.

Open access

Abstract

Secondary abiotic (SAB) IL-10−/− mice constitute a valuable Campylobacter jejuni-induced enterocolitis model. Given that the host-specific gut microbiota plays a key role in susceptibility of the vertebrate host towards or resistance against enteropathogenic infection, we surveyed immunopathological sequelae of C. jejuni infection in human microbiota associated (hma) and SAB IL-10−/− mice. Following oral challenge, C. jejuni readily colonized the gastrointestinal tract of hma and SAB mice, but with lower numbers in the former versus the latter. Whereas hma mice were clinically less severely compromised, both, macroscopic and microscopic inflammatory sequelae of C. jejuni infection including histopathological and apoptotic cell responses in the colon of IL-10−/− mice were comparably pronounced in the presence and absence of a human gut microbiota at day 6 post-infection. Furthermore, C. jejuni infection of hma and SAB mice resulted in similarly enhanced immune cell responses in the colon and in differential pro-inflammatory mediator secretion in the intestinal tract, which also held true for extra-intestinal including systemic compartments. Notably, C. jeuni infection of hma mice was associated with distinct gut microbiota shifts. In conclusion, hma IL-10−/− mice represent a reliable C. jejuni-induced enterocolitis model to dissect the interactions of the enteropathogen, vertebrate host immunity and human gut microbiota.

Open access

Az „Alsóban az élet” című hazai talajállapotot célzó közösségi tudomány program első tapasztalatai és eredményei

The First experiences and results of the Hungarian citizen science program (’Life in Undies’) aimed at soil properties

Agrokémia és Talajtan
Authors:
Mátyás Árvai
,
Tünde Takáts
,
Zsófia Adrienn Kovács
,
Katalin Takács
,
Kitti Balog
,
Péter László
,
Tünde Imréné Takács
,
János Mészáros
, and
László Pásztor

A közösségi tudomány – citizen science – már évtizedek óta működő kutatási forma, ahol egy-egy kutatás a lakosság segítségével valósul meg. Az „Alsóban az élet” kampány az érdeklődők bevonásával 2021 tavaszán indult hazánkban. A kutatásban résztvevők kézhez kaptak egy pamut alsóneműt, amelyet kb. 20 cm-es mélységben kellett elásniuk, ezzel „táplálékot” szolgáltatva a talajlakó élőlények számára. Több mint két hónap elteltével az alsónemű kiásása után megfigyelhetők a bomlási jelek, amelyek mint indikátor jelzik a talajélet aktivitását, közvetett módon a talaj egészségi állapotát. A visszamaradt alsóneműk digitális fotójának elemzésével becsülhető a talajlakó élőlények munkája az alsónadrágok bomlásának százalékos aránya alapján.

A közösségi médiában megjelent felhívások és célzott csoporthirdetések segítségével mintegy 1193-an jelentkeztek a programra összesen 1966 helyszínnel, ezzel országos lefedettséget biztosítva a kutatás részére. Az adatok elemzése alapján a gondozott konyhakertekben elásott pamut alsók mutatták a legnagyobb átlagos bomlási értékeket (27,67%). Talajtípust tekintve a réti talajok és a közép- és délkeleteurópai barna erdő-, valamint a csernozjom-, és a váztalajok (köztük nagyrészt a humuszos homoktalajok) esetén tapasztaltuk a legmagasabb, közel azonos, 25,47%; 25,43%; 24,22%; 24,21%-os bomlási értéket. A programban résztvevő helyszínek közül a legnagyobb mértékű bomlás (93%) konyhakert hasznosítású (mulcsozott veteményes és polikultúra ágyás) váztalajon (homoktalajon) volt megfigyelhető. Az országos átlagos bomlási érték 24,57% volt. A bomlási adatok alapján eredménytérképet szerkesztettünk Magyarország teljes területére, melyet nyilvánossá tettünk, s a résztvevőknek a visszaküldött fotó feldolgozása alapján rövid, a saját talajának biológiai aktivitását minősítő válaszlevelet küldtünk.

Open access

Abstract

This review aimed to evaluate the contamination rate of dental unit waterlines (DUWL) with Pseudomonas aeruginosa and Legionella pneumophila in several countries in the Middle East.

Literature search was conducted in databases such as PubMed, Scopus, Web of Science, and Google Scholar to gather studies published from the beginning of 2000 to 30th April 2020. Medical Subject Headings (MeSH) terms were; “Legionellosis”; “Legionnaire”, “Legionellosis”, “L. pneumophila”, “dent”, “dental”, “dentistry”, “Dental Unit Waterlines”, “dental water”, “DUWL”, “Middle East”, “P. aeruginosa”, “Iran”, “Turkey”, “Iraq”, and “Jordan”. The search was independently conducted by two of the authors. Data was analyzed using Comprehensive Meta-Analysis software.

Almost all studies included in this review reported a high rate of bacterial contamination of DUWL, which exceeded the current standard bacterial contamination level of <200 (CFU) mL−1 recommended by the American Dental Association (ADA). The combined prevalence of L. pneumophila from four countries (Iran, Jordan, Turkey, and Iraq) was 23.5% (95% Cl: 6.5–57.7), and the combined prevalence of P. aeruginosa was reported 21.7% (95% Cl: 7.1–50.1%).

This study showed a high bacterial contamination rate of DUWL with opportunistic pathogens. So, it is recommended to prevent biofilm formation in DUWL, some measures should be extended by practical approaches allowing for water quality control and improvement on-site in the dental practices such as mobile filtration units, chlorination and disinfection chemicals.

Open access

Hígtrágya komplex baktérium-kezelésének hatása egyes beltartalmi és ökotoxikológiai tulajdonságokra

The effect of complex bacterial treatment of slurry on content and ecotoxicological properties

Agrokémia és Talajtan
Authors:
Dóra Pordán-Háber
,
Pál Szakál
,
Eduárd Gubó
,
Orsolya Réka Rácz
,
Krisztina Mónika Terdik
, and
Judit Plutzer

Kutatásunk témája az NCH Magyarország Kft. által forgalmazott baktériumos hígtrágyakezelési rendszer összehasonlító ökotoxikológiai vizsgálata. A kísérletet egy szarvasmarha borjúnevelő telepen végeztük 0–6 hónapos korcsoportú szekcióban. A tabletta formában rendelkezésünkre álló baktérium törzseket egy tartályban felszaporítottuk és hetente adagoltuk az aknában összegyűlő hígtrágyához. A kezelés célja volt, hogy a baktériumok elősegítsék a trágya homogenizációját, a szagcsökkentést és a szerves szennyeződések lebontását. Az ökotoxikológiai vizsgálatokat a trágyakezelés előtt, alatt és után, három mintavételi időben végeztük el.

A kutatásunk eredményeként elmondhatjuk, hogy a hígtrágyakezelés során a beltartalmi értékek jelentősen növekedtek, főként a nitrogénformák, a biológiai oxigénigény és a szárazanyagtartalom. Az ösztrogén hatás megléte számottevő maradt a kezelés végére is. A fitotoxicitási vizsgálat alapján mindegyik növény, szár- és gyökérnövekedésére pozitív hatással volt a trágyakezelés. A talajtoxicitási teszt eredménye bizonyította, hogy magasabb hígítás mellett veszti el a kezeletlen hígtrágya az érzékeny baktériumok élettevékenységére is kiterjedő gátló hatását. A békalencse vizsgálat során összességében elmondható, hogy 150× hígítás fölött megszűnik a hígtrágya gátló hatása mindhárom alkalommal vett minta esetében. Az alga növekedésgátlására a hígtrágya stagnáló-gátló tendenciát mutatott a kezelés alatt.

Eredményeink alapján arra a következtetésre jutottunk, hogy a vizsgált hígtrágyakezelési módszer a homogenitás, szagtalanítás és a szerves anyagok bontása során eredményes volt. Azonban javasolt magasabb hígítási arányban vagy magas talajvíztartalom mellett kijuttatni a földekre. A hormonhatású anyagok eltávolítására vonatkozólag további vizsgálatok szükségesek, melyek alapján majd javaslatokat lehet kidolgozni a gazdák számára.

Open access

Abstract

In this paper, three new species of the alycaeid genus Dicharax Kobelt & Möllendorff, 1900 are described, namely Dicharax floridus n. sp., Dicharax spatiosus n. sp. (Both from Shan State, Myanmar) and Dicharax kosztarabi n. sp. (from Thailand). All three new species are known from their holotypes.

http://zoobank.org/28168F06-CFBF-405F-90F7-A3399060D88C

Open access

Abstract

Oleogels have been extensively investigated in the food processing in recent years, and they have become one of the healthier alternative. The possibility of constructing oleogel material in a manner similar to hydrocolloid gel has now been gradually becoming a reality. In this regard, this review provides coverage of the latest developments and applications of oleogels in terms of preparation strategies, physicochemical properties, health aspects, and potential food applications. Both solid fat content and crystallisation behaviour are discussed for oleogels fabricated by gelators and under different conditions. Oleogels could replace hydrogenated vegetable oils in food product, reduce the fatty acid content, and be used to prepare food products such as meat, ice-cream, chocolate, bread, and biscuits with desirable properties. The aims were to assess the formation mechanism, construction methods of oleogels and the advance on the application of oleogel structures in the food field, as well as the further exploration of oleogels and in complex food systems in the future.

Open access

With 22 taxa reported from the country so far, Epipactis is the most species-rich orchid genus in Hungary. Many of them are rare, threatened species. To protect endangered species effectively, it is crucial to explore their ecology. Our work aimed to select and examine factors that are influencing the distribution of Epipactis species. Our data collection (2014–2018) was carried out in the Keszthely Hills, in the northeastern part of the Zala Hills and the Southern Bakony Mountains. We assigned ecologically relevant data from databases of local forestries, terrain models and geological maps to each occurrence. We examined the factors that result in the best differentiation between the studied species. At 1,261 localities, a total of 5,223 individuals of 15 taxa were found. We found three factors (tree species composition of the forest, genetic soil type, bedrock type) that significantly influenced the distribution of Epipactis species. Our results can help understand the distribution patterns of these species and allow for more effective, targeted protection of their potential habitats on a regional level.

Open access

The lack of knowledge on the traits related to the germination and establishment of native plant species represents obstacles to restoration. Seed mass, germination and emergence variability from two characteristic grasses (Festuca vaginata and Stipa borysthenica), and two dicots (Centaurea arenaria and Dianthus serotinus) of Hungarian sandy grasslands from altogether 34 localities were tested. Our results showed that seed mass had a significant positive effect on germinability of the dicots and on seedling emergence of all species. The laboratory germination capacity of S. borysthenica was low due to dormancy. We found a significant variability among seed traits and emergence between localities in all the species except for the germination of S. borysthenica. This significant variation among populations might be explained by local adaptation or maternal effects. We conclude that germination under laboratory-regulated conditions is a good predictor of seedling emergence for restoration projects, but limited to species with non-dormant seeds.

Open access