Search Results

You are looking at 1 - 10 of 98 items for :

  • "DNA methylation" x
  • Refine by Access: All Content x
Clear All
Biologia Futura
Authors: Muhammad Saad, Helen Mary, Umar Amjid, Ghulam Shabir, Kashif Aslam, Shahid Masood Shah, and Abdul Rehman Khan

process. Different epigenetic marks like DNA methylation and histone modification play their role in modulating the plant stress response. Among these, DNA methylation is most stable epigenetic mechanism that can have implications in crop

Restricted access

Cervera MT, Ruiz-Garcia L, Martinez-Zapater JM (2002) Analysis of DNA methylation in Arabidopsis thaliana based on methylation-sensitive AFLP markers. Mol Genet Genomics 268 : 543–552 Martinez-Zapater J

Restricted access

Arnholdt-Schmitt, B., Herterich, S., Neumann, K. H. (1995) Physiological aspects of genome variability in tissue culture. I. Growth phase-dependent differential DNA methylation of the carrot genome ( Daucus

Restricted access
Orvosi Hetilap
Authors: Krisztina Andrea Szigeti, Orsolya Galamb, Alexandra Kalmár, Barbara Kinga Barták, Zsófia Brigitta Nagy, Eszter Márkus, Péter Igaz, Zsolt Tulassay, and Béla Molnár

–174. 13 Li E, Beard C, Jaenisch R. Role for DNA methylation in genomic imprinting. Nature 1993; 366: 362–365. 14 Yamagata Y, Szabó P, Szüts D, et al. Rapid turnover of DNA

Open access

Maize, a moderately salt sensitive crop, first experiences osmotic stress that cause reduction in plant growth under salt stress. Fluctuation in cell wall elongation is one of the reasons of this reduction. Along with others, two important proteins expansins and xyloglucan endotransglucosylase are involved in regulation of cell wall elasticity, but the role of epigenetic mechanisms in regulating the cell wall related genes is still elusive. The present study was conducted with the aim of understanding the role of DNA methylation in regulating ZmEXPB2 and ZmXET1 genes. One salt sensitive and one salt tolerant maize cultivar was grown under hydroponic conditions at different levels of salt stress: T1 = 1 mM (control), T2 = 100 mM and T3 = 200 mM in three replicates. DNA and RNA were extracted from roots. After bisulfite treatment, Methyl Sensitive PCR was used for the DNA methylation analysis. It was revealed that fragment in promoter of ZmEXPB2 gene showed high level of DNA methylation under T1 in both varieties. Comparison of different stress treatments revealed decrease in DNA methylation with the increase in salt stress, significantly lower methylation appearing in T3. Similarly, the fragment in promoter of ZmXET1 gene also showed high levels of DNA methylation in T1. When different treatments were analysed, this gene significantly hypomethylated at T2 which continued to decrease in T3 in sensitive variety but remain stable in tolerant variety. Although, further in-depth analysis is required, our results demonstrate region-specific and genotype-specific methylation shift in the promoter of the ZmEXPB2 and ZmXET1 genes when subjected to the salt stress confirming the epigenetic regulation of these genes under stress conditions.

Restricted access

A synthetic autopolyploid was developed from diploid Aegilops tauschii, D genome progenitor of common wheat (Triticum aestivum). The tetraploid Ae. tauschii displayed a markedly larger organ size than the diploid donor. Fluorescence in situ hybridization (FISH) and DNA marker analysis revealed that there is no clear variation at either the chromosomal or DNA level between the diploid and tetraploid plants. We analyzed the variation in cytosine methylation patterns between the diploid and tetraploid plants by methylation-sensitive amplified polymorphism (MSAP) and detected 228 and 232 methylated sites in diploid and tetraploid plants, respectively. Statistical comparison indicated that the tetraploid Ae. tauschii genotype displayed no significant difference in polymorphic methylation level compared to the diploid ones. Twenty-two different genomic fragments displaying different methylation behavior during the ploidy conversions were isolated and sequenced. It demonstrated that alterations in the level of methylation have the most profound effects on coding genes. We demonstrated that there are some genes expressions modified by DNA methylation may be correlated with phenotypic alteration after autotetraploidization.

Restricted access

There is no doubt that diet could effectively improve health and halt cancers. Dietary phytochemical compounds and their derivatives represent a cornucopia of effectively anticancer compounds. This review discusses existing data on the anticancer activities of curcumin, and then offers possible explanations for and mechanisms of its cancer-preventive action. This review also offers insights into the molecular mechanism and targets through which curcumin modulates cell cycle, apoptotic signals, anti-apoptotic proteins, miRNAs, Wnt/beta-catenin signaling, protein kinases, nuclear factor-κB, proteasome activation, epigenetic regulation including DNA methylation and histone modification. Finally, this review provides explanations for how curcumin reverses the multi-drug resistance (MDR) of cancer cells.

Open access
Orvosi Hetilap
Authors: Orsolya Dóra Ács, Bálint Péterfia, Péter Hollósi, Irén Haltrich, Ágnes Sallai, Andrea Luczay, Karin Buiting, Bernhard Horsthemke, Dóra Török, András Szabó, and György Fekete

Absztrakt:

Bevezetés: A nemzetközi szakirodalmi adatok alapján az SNRPN génlocus promoter régiójának DNS-metilációs vizsgálata jelenleg a legérzékenyebb és leghatékonyabb kezdeti lépés a Prader–Willi-szindróma-gyanús betegek genetikai vizsgálatakor. Célkitűzés: Célunk egy egyszerű, megbízható, könnyen hozzáférhető, elsődlegesen diagnosztikus, DNS-metiláción alapuló eljárás kidolgozása volt Prader–Willi-szindróma igazolására. Módszer: Vizsgálatunk során az általunk módosított, költséghatékony, metilációszenzitív, nagy felbontású olvadáspont-elemzéses technikát hasonlítottuk össze a leginkább elterjedt, költséges metilációspecifikus multiplex ligatiofüggő próbaamplifikációs technikával. Klinikailag a Prader–Willi-szindróma több tünetét mutató 17 gyermek DNS-metilációs vizsgálatát végeztük el saját tervezésű primerekkel: biszulfitszekvenáló polimeráz-láncreakció, metilációszenzitív nagy felbontású olvadáspont-elemzés és kontrollként metilációspecifikus multiplex ligatiofüggő próbaamplifikáció történt. Eredmények: A metilációszenzitív nagy felbontású olvadáspont-elemzés és a metilációspecifikus multiplex ligatiofüggő próbaamplifikáció eredményei minden esetben megegyeztek. A 17 esetből 6 esetben igazolódott a Prader–Willi-szindróma. Következtetés: Az általunk használt DNS-metiláción alapuló módszer, amelyben együttesen alkalmaztunk egyedi tervezésű primereket és módosított biszulfitszekvenáló polimeráz-láncreakciót, egyszerű, gyors, megbízható és hatékony vizsgálatnak bizonyult a Prader–Willi-szindróma elsődleges igazolására. Orv Hetil. 2018; 159(2): 64–69.

Open access

Absztrakt

Az életmód változásával és a gyorséttermi láncok elterjedésével egyre nagyobb problémát jelent az elhízás az egész világon. Indiában a férfiak 31%-a, a nők 29%-a túlsúlyos, és az elhízás az utóbbi 11 évben növekvő tendenciát mutat. Az elhízás növeli számos betegség kialakulásának esélyét, mint például a szív- és érrendszeri betegségek, refluxbetegség, gastrointestinalis tumorok és alvási apnoe. Műtétek során a szövődményekkel még nem járó elhízás is súlyos komplikációkat okozhat. Az Ájurvédában a betegségek kialakulásáért a 3 dosha – vata, pitta, kapha – egyensúlyának felborulása a felelős. A 3 dosha aránya egyénenként változik, és meghatározza az egyéni testalkatot. Egy indiai kutatócsoport kimutatta, hogy az ájurvédikus testtípus-besorolás kapcsolatba hozható a gyulladásos és oxidatívstressz-faktorok génjeivel, a DNS-metilációval és a cardiovascularis betegségek kialakulásának esélyeivel. Orv. Hetil., 2016, 157(34), 1349–1352.

Open access
Orvosi Hetilap
Authors: Barbara Kinga Barták, Eszter Márkus, Alexandra Kalmár, Orsolya Galamb, Krisztina Szigeti, Zsófia Brigitta Nagy, Sára Zsigrai, Zsolt Tulassay, Magdolna Dank, Péter Igaz, and Béla Molnár

colorectal cancer screening and diagnosis. Expert Rev Mol Diagn. 2016; 16: 239–252. 36 Kurdyukov S, Bullock M. DNA methylation analysis: choosing the right method. Biology 2016; 5: 3

Open access