Search Results

You are looking at 1 - 10 of 146 items for :

  • "PCR method" x
  • Refine by Access: All Content x
Clear All

It is well established that the ingestion of cereal prolamins, such as gluten, causes the characteristic symptoms of celiac disease (CD) in people predisposed to it. DNA-based PCR method provides new ways to detect gluten in processed foodstuffs, such as bread. The aim of this work was to adapt a new primer pair combination and to initiate a carefully elaborated PCR methodology to experiment with DNA-based analysis. At first, the purity of cleaned DNA was verified using B49317 and A49855 chloroplast DNA primer pair. Then TR01/2 wheat specific PCR primer pair was used for checking the origin of the DNA, and P1/2 microsatellite (SSR) adapted primer pair for detecting allergen (gluten) specific residues. Method optimisation was achieved with cereal flour samples, then bread and dry pasta products from wheat were used, which were analysed as heat-treated samples with three primer pairs. The gluten specific primer pair was tested on cross-reactive cereals such as rye, barley, triticale and on some questionable cereals, such as oat, and pseudo-cereals, e.g. buck wheat and amaranth.

Restricted access
Orvosi Hetilap
Authors: Bálint Nagy, Levente Lázár, Gyula Richárd Nagy, Zoltán Bán, and Zoltán Papp

Bevezetés: A Toxoplasma gondii (T. gondii) által okozott fertőzés általában tünetmentes, vagy csak enyhe panaszokat okoz. A terhesekre azonban veszélyt jelent a parazita. A T. gondiiv al fertőzött anyáról a kórokozó transplacentalisan a magzatot is megfertőzheti és congenitalis toxoplasmosist okozhat, amely súlyos magzati elváltozásokat idézhet elő. A korai diagnózis a kezelés sikerét növeli. A congenitalis toxoplasmosis kimutatható szerológiai és molekuláris biológiai módszerekkel. Cél: A T. gondii kimutatása a kvantitatív valós idejű PCR-módszerrel magzatvízből. Módszerek: A magzatvízből a DNS-t szilika adszorbciós módszerrel izoláltuk. A T. gondii kimutatása 74 mintából történt meg kvantitatív valós idejű PCR-módszerrel. Eredmények: A szerzők 74 magzatvízmintából hat esetben mutatták ki a parazita jelenlétét. Konklúzió: A kvantitatív valós idejű PCR-módszer megnöveli a kimutatás gyorsaságát és érzékenységét, valamint lehetőséget nyújt a kórokozó mennyiségi meghatározására is. Ez új utat nyithat a prognózis megállapítására, valamint a kezelés eredményességének a monitorizálására.

Restricted access
Orvosi Hetilap
Authors: Levente Lázár, Bálint Nagy, Zoltán Bán, Gyula Richárd Nagy, Artúr Beke, and Zoltán Papp

Bevezetés: Az anyai vérben keringő szabad magzati DNS kimutatása a noninvazív praenatalis diagnosztika egyik sarokkövévé vált az elmúlt két évtized során. Az anya perifériás keringésében fellelhető szabad magzati DNS felhasználása a praenatalis diagnosztikában az anyai és magzati eredetű DNS különbségén alapszik. Az egyik ilyen különbség az anya és a magzat közötti vércsoporteltérés genetikai háttere. A vércsoport-összeférhetetlenségek közül az Rh-konstelláció a leggyakoribb a klinikai gyakorlatban. Célkitűzés: A szerzők által végzett vizsgálat célja, a szakirodalomban fellelhető eredmények tükrében, a magzati Rh-státus anyai vérből történő meghatározása volt. Módszer: A terhesség 11. és 22. hete között 30 Rh-negatív vércsoportú terhes vérplazmájából, valamint a vérvételt követő amniocentézis során nyert magzatvízből izolált DNS-mintából real-time PCR-módszer segítségével, az 1 kromoszómán (1p36.11) található RhD 7 exon kimutatásával meghatározták a magzat Rh-státusát. Eredmények: A real-time PCR-vizsgálat 24 esetben azonos eredményt adott a RhD 7-es exonjára vonatkozóan a magzatvíz-mintákból, illetve az anyai vérplazmából izolált DNS esetében. Hat esetben a magzatvízből izolált DNS pozitív, a plazmából izolált szabad DNS vizsgálata negatív eredményt adott. A magzatvízből történő RhD-meghatározás során öt esetben nem, huszonöt esetben kimutatható volt az RhD-gén 7 exonja. Következtetések: A real-time PCR egy viszonylag egyszerű és megbízható módszernek bizonyult az anyai vérplazmából történő magzati vércsoport Rh-meghatározására. A módszer érzékenységére vonatkozó eredmények a szakirodalommal összhangban biztatóak, a módszer érzékenysége több marker felhasználásával növelhető. További, nagyobb esetszámú vizsgálat elvégzése a módszer rutin klinikai gyakorlatban történő alkalmazását is lehetővé teszi.

Restricted access

The king oyster mushroom (Pleurotus eryngii) is becoming more and more popular amongst the producers due to its excellent taste and relatively easy cultivation technology. Though investigations aiming to involve the mushroom in industrial cultivation had started in Hungary already in the 1950s, significant efforts were not made until 2002. In contrast to this, the volume of production in Europe and the United States has been growing continuously in the last decade. Although the species have been subjected to some taxonomical investigations, there are still a lot of contradictions in the taxonomic positioning of the P. eryngii species complex. In this study we investigated the genetic variability and taxonomic relationships among P. eryngii strains by using the RAPD-PCR method. Fifteen strains were analysed from our collection that represents mostly the Eastern-Hungarian habitats. Twenty-five random decamer primers were tested in the preliminary experiments and six were chosen that were used for binary coding. A neighbour-joining tree prepared from this matrix shows the coherence among the taxonomic relations and production sites of the potentially cultivable Hungarian strains.

Restricted access

The fluorescence-based real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) is becoming widely used to quantify mRNA level in cells and tissues and is now a crucial tool for basic biological researches and biotechnology. In the present study, on the basis of the real-time quantitative RT-RCR, we detected and quantified mRNA copies of the transcription factor, CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP; an immediate-early gene that is involved in synaptic plasticity and learning and memory) in the central nervous system of the pond snail Lymnaea stagnalis. We designed the primer set and the probe in the specific insert for the detection of Lymnaea C/EBP (LymC/EBP) clone 1. This insert is not contained in LymC/EBP clone 2 by alternative splicing. The copy number of LymC/EBP clone 1 was linearly decreased relative to the dilution of cDNA, and it was estimated 30 copies/ml in test sample. The availability of the present study showed that the real-time quantitative RT-PCR technique is more accurate and more specific for the detection and quantification of the mRNA level of genes in L. stagnalis than the other PCR methods.

Restricted access
Acta Alimentaria
Authors: E. Szabó, É. Gelencsér, E. Kovács, A. Jánosi, K. Takács, and E. Kiss

In our research we studied the occurrence of the main apple allergen coding gene-families (Mal d 1, Mal d 2, Mal d 3, Mal d 4) in 16 different and most preferably consumed apple varieties. After the DNA isolation by Wizard method the simple PCR reaction was used to examine the apple allergen-coding genes. To identify the presence of the four allergenic protein-coding genes two primer pairs were chosen. The presence of these allergens in most apple varieties could be confirmed. According to our results two varieties — Jonathan and Granny Smith — were found to contain the lowest amount of the coding genes of the allergenic apple proteins studied by us. Besides this, polymorph pattern was obtained by the use of Mal d 1 primer, which may lead to determine apple varieties with small amount of Mal d 1 allergens.The confirmation study of the presence of potential apple allergens by RNA and protein techniques is our plan in the near future.

Restricted access

., Xing, D., Shen, X. & Zhu, D. (2004b): Detection of genetically modified organisms by electrochemiluminescence PCR method. Biosens. Bioelectron. , 20 , 436–441. Zhu D

Restricted access

won , D.Y. , … & K im , J.H. ( 2011 ): A RAPD-PCR method for the rapid detection of Bacillus cereus . J. Microbiol. Biotechnol. , 21 ( 3 ), 274 – 276 . L ogan , N.A. & B

Open access

. , Marincs , F. , Tóth , P. & Rátky , J. ( 2013 ). Mangalica termékek kimutatására alkalmas real-time PCR módszer fejlesztése (Development of a realtime PCR method for the detection of Mangalitza products) . Élelmiszertudomány és Technológia , 3

Open access
Acta Veterinaria Hungarica
Authors: Ching-Yang Cheng, Jing-Ruei Chi, Sin-Rong Lin, Chi-Chiang Chou, and Chin-Cheng Huang

Brinkman, N. E., Haugland, R. A., Wymer, L. J., Byappanahalli, M., Whitman, R. L. and Vesper, S. J. (2003): Evaluation of a rapid, quantitative real-time PCR method for enumeration of pathogenic Candida cells in water. Appl. Environ. Microbiol. 69

Restricted access