Search Results

You are looking at 1 - 4 of 4 items for :

  • "gene chip" x
  • All content x
Clear All

Aegiolops kotschyi cytoplasmic male sterile system often results in part of haploid plants in wheat (Triticum aestivum L.). To elucidate the origin of haploid, 235 wheat microsatellite (SSR) primers were randomly selected and screened for polymorphism between haploid (2n = 3x = 21 ABD) and its parents, male-sterile line YM21 (2n = 6x = 42 AABBDD) and male fertile restorer YM2 (2n = 6x = 42 AABBDD). About 200 SSR markers yielded clear bands from denatured PAGE, of which 180 markers have identifiable amplification patterns, and 20 markers (around 8%) resulted in different amplification products between the haploid and the restorer, YM2. There were no SSR markers that were found to be distinguishable between the haploid and the male sterile line YM21. In addition, different distribution of HMW-GS between endosperm and seedlings from the same seeds further confirmed that the haploid genomes were inherited from the maternal parent. After haploidization, 1.7% and 0.91% of total sites were up- and down-regulated exceeding twofold in the shoot and the root of haploid, respectively, and most of the differentially expressed loci were up/down-regulated about twofold. Out of the sensitive loci in haploid, 94 loci in the shoot, 72 loci in the root can be classified into three functional subdivisions: biological process, cellular component and molecular function, respectively.

Restricted access
Orvosi Hetilap
Authors: Orsolya Kiss, Anna-Mária Tőkés, Sándor Spisák, Anna Szilágyi, Norbert Lippai, A. Marcell Szász, and Janina Kulka

Bevezetés: Az adenoid cysticus carcinoma a nyálmirigyeket érintő rosszindulatú daganat, ritkán azonban az emlő mirigyeiből is kiindulhat. A nyálmirigyből kiinduló forma nagyon agresszív kimenetelt mutat, az emlőmirigy adenoid cysticus tumora azonban általában igen kedvező prognózissal bír. Célkitűzés: A szerzők célul tűzték ki az emlőmirigyből és nyálmirigyből kiinduló adenoid cysticus carcinoma esetek miRNS-mintázatának összehasonlítását. Módszer: Két-két, emlőből és nyálmirigyből származó adenoid cysticus carcinoma és egy-egy normális emlő- és nyálmirigyszövetet vizsgáltak. A miRNS-profilt Affymetrix® Gene Chip segítségével határozták meg. Eredmények: Egyes miRNS-ek expressziója emlő- és nyálmirigy-eredetű tumorokban eltért a normális kontrolljukhoz képest: a let-7b expressziója a nyálmirigy-eredetű tumorokban fokozott, míg emlőmirigyből származó adenoid cysticus carcinoma szövetekben csökkent volt, a miR-24 expressziója pedig ezzel ellentétesen változott: emlőeredetű adenoid cysticus carcinoma szövetekben emelkedést mutatott, míg a nyálmirigy tumoraiban csökkent mértékben expresszálódott. A miR-181a-2* kizárólag a nyálmirigy-eredetű adenoid cysticus carcinoma esetekben volt detektálható. Következtetések: A gének poszttranszkripcionális szabályozása révén egyes miRNS-ek eltérő expressziója részleges magyarázatot adhat a két szerv adenoid cysticus tumorainak eltérő klinikai lefolyására. Orv. Hetil., 2013, 154, 963–968.

Open access
Cereal Research Communications
Authors: Jas Singh, Leonid Savitch, Gopal Subramaniam, Ghislaine Allard, Mark Jordan, Philippe Couroux, Radhey Pandeya, Andre Kalikililo, and Jennifer Douglas

The maize Golden2-like or GLK genes encode proteins belonging to a class of GARP domain transcriptional activators. GLKs have been observed to be involved in chloroplast development and stress adaptation. In spite of the importance of GLKs in plant processes, the in planta targets of GLK regulated transcription, however, have not been identified. We use GLK1 overexpression (OE) to study reprogramming of gene expression networks by GLK1 in Arabidopsis and to identify an associated phenotype. GLK1 OE in Arabidopsis confers resistance to Fusarium graminearum , a broad host pathogen responsible for major losses in cereal crops. Affymetrix Gene Chip and RT-PCR analyses indicated that GLK1 OE in Arabidopsis reprogrammed gene expression networks to enhance a high constitutive expression of genes encoding proteins involved in basal defences but downregulated genes that are associated with programmed cell death and hypersensitive responses. The nature of the role of GLK1 overexpression in selectively reprogramming defence gene networks could explain its effectiveness in enhancing the development of resistance to the necrotrophic phase of F. graminearum pathogenesis.

Restricted access

63 69 Simkhovich, B. Z., Marjoram, P., Poizat, C., Kedes, L., Kloner, R. A. (2003) Brief episode of ischemia activates protective genetic program in rat heart: a gene chip

Restricted access