View More View Less
  • 1 Semmelweis Egyetem, Általános Orvostudományi Kar II. Belgyógyászati Klinika Budapest Szentkirályi utca 46. 1088
  • 2 Semmelweis Egyetem, Általános Orvostudományi Kar Transzplantációs és Sebészeti Klinika Budapest
Open access

Háttér: A vastagbéldaganatok kialakulásának és progressziójának molekuláris folyamata, valamint az ennek hátterében álló fehérjeszintű változások nem ismertek. A microarray-rendszerek alkalmazása több száz vagy ezer fehérjekomponens párhuzamos vizsgálatával újabb információkat adhat ezeknek a kérdéseknek a megválaszolásához. Célkitűzés: A daganatkialakulás és -progresszió fehérjeszintű markereinek azonosítása ellenanyagcsipekkel, valamint validálása szöveti microarray-rendszerrel. Célunk továbbá olyan fehérjeszintű markerkombinációk azonosítása, amelyek lehetővé teszik a korai és kései vastagbéldaganatok molekuláris módszerekkel történő elkülönítését és diagnosztizálását. Anyag és módszer: Tíz Dukes B, valamint 6 Dukes D stádiumú beteg sebészi úton eltávolított, friss fagyasztott daganatos és ép mintáit vizsgáltuk meg. A homogenizált mintákból nyert nyers fehérjepreparátumokat Clontech AB500 array-re hibridizáltuk. Tizenkét kiválasztott gén validálása szöveti microarray (TMA) -technológiával történt. Eredmények: A makroszkóposan ép és daganatos területek között 67 szignifikáns, fehérjeszinten eltérő expressziót mutató gént azonosítottunk (p < 0,05), amelyek az apoptózis (5), sejtciklus-szabályozás (7), transzkripciószabályozás (4) és DNS-replikáció (6), illetve más olyan, mint transzport, sejtadhézió (45) sejtfunkcióiban vesznek részt. Immunohisztokémiai alapú TMA-val igazoltuk 12 marker: a CYCA1, HSP60, TOP1, APC, CBP, ERK, EGFR, C-myc, Cald, DARPP32, MRE11A, AR, EPS8 génekben kapott eltéréseket morfológiai szinten is. Megbeszélés: Eredményeink szerint a tumoros kialakulás fehérjecsippel meghatározott, morfológiai szinten ellenőrzött markerei a sejtfunkció széles spektrumát érintik. A daganat progressziós markerei az apoptózis, sejtciklus szabályozása és a jelátviteli utak sejtfunkcióit érintik. Sikerült egy olyan 6 fehérjéből álló markerkombinációt meghatároznunk, amely lehetővé teszi a korai és késői daganatok elkülönítését.

If the inline PDF is not rendering correctly, you can download the PDF file here.

  • Madoz-Gurpide, J., Canamero, M., Sanchez, L. és mtsai: A proteomics analysis of cell signaling alterations in colorectal cancer. Mol. Cell. Proteomics, 2007, 6 , 2150–2164.

    Sanchez L. , 'A proteomics analysis of cell signaling alterations in colorectal cancer ' (2007 ) 6 Mol. Cell. Proteomics : 2150 -2164.

    • Search Google Scholar
  • Jass, J. R.: Classification of colorectal cancer based on correlation of clinical, morphological and molecular features. Histopathology, 2007, 50 , 113–130.

    Jass J. R. , 'Classification of colorectal cancer based on correlation of clinical, morphological and molecular features ' (2007 ) 50 Histopathology : 113 -130.

    • Search Google Scholar
  • Calin, G. A., Croce, C. M.: MicroRNA-cancer connection: the beginning of a new tale. Cancer Res., 2006, 66 , 7390–7394.

    Croce C. M. , 'MicroRNA-cancer connection: the beginning of a new tale ' (2006 ) 66 Cancer Res. : 7390 -7394.

    • Search Google Scholar
  • Calin, G. A., Croce, C. M.: MicroRNAs and chromosomal abnormalities in cancer cells. Oncogene, 2006, 25 , 6202–6210.

    Croce C. M. , 'MicroRNAs and chromosomal abnormalities in cancer cells ' (2006 ) 25 Oncogene : 6202 -6210.

    • Search Google Scholar
  • Calin, G. A., Croce, C. M.: MicroRNA signatures in human cancers. Nat. Rev. Cancer, 2006, 6 , 857–866.

    Croce C. M. , 'MicroRNA signatures in human cancers ' (2006 ) 6 Nat. Rev. Cancer : 857 -866.

  • Garzon, R., Fabbri, M., Cimmino, A. és mtsai: MicroRNA expression and function in cancer. Trends Mol. Med., 2006, 12 , 580–587.

    Cimmino A. , 'MicroRNA expression and function in cancer ' (2006 ) 12 Trends Mol. Med. : 580 -587.

    • Search Google Scholar
  • Markowitz, S. D., Roberts, A. B.: Tumor suppressor activity of the TGF-beta pathway in human cancers. Cytokine Growth Factor Rev., 1996, 7 , 93–102.

    Roberts A. B. , 'Tumor suppressor activity of the TGF-beta pathway in human cancers ' (1996 ) 7 Cytokine Growth Factor Rev. : 93 -102.

    • Search Google Scholar
  • Rampino, N., Yamamoto, H., Ionov, Y. és mtsai: Somatic frameshift mutations in the BAX gene in colon cancers of the microsatellite mutator phenotype. Science, 1997, 275 , 967–969.

    Ionov Y. , 'Somatic frameshift mutations in the BAX gene in colon cancers of the microsatellite mutator phenotype ' (1997 ) 275 Science : 967 -969.

    • Search Google Scholar
  • Souza, R. F., Appel, R., Yin, J. és mtsai: Microsatellite instability in the insulin-like growth factor II receptor gene in gastrointestinal tumours. Nat. Genet., 1996, 14 , 255–257.

    Yin J. , 'Microsatellite instability in the insulin-like growth factor II receptor gene in gastrointestinal tumours ' (1996 ) 14 Nat. Genet. : 255 -257.

    • Search Google Scholar
  • Fearon, E. R., Vogelstein, B.: A genetic model for colorectal tumorigenesis. Cell, 1990, 61 , 759–767.

    Vogelstein B. , 'A genetic model for colorectal tumorigenesis ' (1990 ) 61 Cell : 759 -767.

  • Leslie, A., Carey, F. A., Pratt, N. R. és mtsai: The colorectal adenoma-carcinoma sequence. Br. J. Surg., 2002, 89 , 845–860.

    Pratt N. R. , 'The colorectal adenoma-carcinoma sequence ' (2002 ) 89 Br. J. Surg. : 845 -860.

    • Search Google Scholar
  • Vogelstein, B., Fearon, E. R., Hamilton, S. R. és mtsai: Genetic alterations during colorectal-tumor development. N. Engl. J. Med., 1988, 319 , 525–532.

    Hamilton S. R. , 'Genetic alterations during colorectal-tumor development ' (1988 ) 319 N. Engl. J. Med. : 525 -532.

    • Search Google Scholar
  • Jass, J. R., Biden, K. G., Cummings, M. C. és mtsai: Characterisation of a subtype of colorectal cancer combining features of the suppressor and mild mutator pathways. J. Clin. Pathol., 1999, 52 , 455–460.

    Cummings M. C. , 'Characterisation of a subtype of colorectal cancer combining features of the suppressor and mild mutator pathways ' (1999 ) 52 J. Clin. Pathol. : 455 -460.

    • Search Google Scholar
  • Caron de Fromentel, C., Soussi, T.: TP53 tumor suppressor gene: a model for investigating human mutagenesis. Genes Chromosomes Cancer, 1992, 4 , 1–15.

    Soussi T. , 'TP53 tumor suppressor gene: a model for investigating human mutagenesis ' (1992 ) 4 Genes Chromosomes Cancer : 1 -15.

    • Search Google Scholar
  • Zhang, D., Wang, Y., Bai, Y. és mtsai: A novel method to quantify local CpG methylation density by regional methylation elongation assay on microarray. BMC Genomics, 2008, 9 , 59.

    Bai Y. , 'A novel method to quantify local CpG methylation density by regional methylation elongation assay on microarray ' (2008 ) 9 BMC Genomics : 59 -.

    • Search Google Scholar
  • Haab, B. B.: Antibody arrays in cancer research. Mol. Cell Proteomics, 2005, 4 , 377–383.

    Haab B. B. , 'Antibody arrays in cancer research ' (2005 ) 4 Mol. Cell Proteomics : 377 -383.

  • Galamb, O., Sipos, F., Dinya, E. és mtsai: MRNA expression, functional profiling and multivariate classification of colon biopsy specimen by cDNA overall glass microarray. World J. Gastroenterol., 2006, 12 , 6998–7006.

    Dinya E. , 'MRNA expression, functional profiling and multivariate classification of colon biopsy specimen by cDNA overall glass microarray ' (2006 ) 12 World J. Gastroenterol. : 6998 -7006.

    • Search Google Scholar
  • Galamb, O., Sipos, F., Molnar, B. és mtsai: Evaluation of malignant and benign gastric biopsy specimens by mRNA expression profile and multivariate statistical methods. Cytometry B. Clin. Cytom., 2007, 72 , 299–309.

    Molnar B. , 'Evaluation of malignant and benign gastric biopsy specimens by mRNA expression profile and multivariate statistical methods ' (2007 ) 72 Cytometry B. Clin. Cytom. : 299 -309.

    • Search Google Scholar
  • Baylin, S. B., Herman, J. G., Graff, J. R. és mtsai: Alterations in DNA methylation: a fundamental aspect of neoplasia. Adv. Cancer Res., 1998, 72 , 141–196.

    Graff J. R. , 'Alterations in DNA methylation: a fundamental aspect of neoplasia ' (1998 ) 72 Adv. Cancer Res. : 141 -196.

    • Search Google Scholar
  • Chen, R. Z., Pettersson, U., Beard, C. és mtsai: DNA hypomethylation leads to elevated mutation rates. Nature, 1998, 395 , 89–93.

    Beard C. , 'DNA hypomethylation leads to elevated mutation rates ' (1998 ) 395 Nature : 89 -93.

    • Search Google Scholar
  • Eden, S., Cedar, H.: Role of DNA methylation in the regulation of transcription. Curr. Opin. Genet. Dev., 1994, 4 , 255–259.

    Cedar H. , 'Role of DNA methylation in the regulation of transcription ' (1994 ) 4 Curr. Opin. Genet. Dev. : 255 -259.

    • Search Google Scholar
  • Jones, P. A., Laird, P. W.: Cancer epigenetics comes of age. Nat. Genet., 1999, 21 , 163–167.

    Laird P. W. , 'Cancer epigenetics comes of age ' (1999 ) 21 Nat. Genet. : 163 -167.

  • Spisak, S., Tulassay, Z., Molnar, B. és mtsai: Protein microchips in biomedicine and biomarker discovery. Electrophoresis, 2007, 28 , 4261–4273.

    Molnar B. , 'Protein microchips in biomedicine and biomarker discovery ' (2007 ) 28 Electrophoresis : 4261 -4273.

    • Search Google Scholar
  • Birkenkamp-Demtroder, K., Olesen, S. H., Sorensen, F. B. és mtsai: Differential gene expression in colon cancer of the caecum versus the sigmoid and rectosigmoid. Gut, 2005, 54 , 374–384.

    Sorensen F. B. , 'Differential gene expression in colon cancer of the caecum versus the sigmoid and rectosigmoid ' (2005 ) 54 Gut : 374 -384.

    • Search Google Scholar
  • Bertucci, F., Salas, S., Eysteries, S. és mtsai: Gene expression profiling of colon cancer by DNA microarrays and correlation with histoclinical parameters. Oncogene, 2004, 23 , 1377–1391.

    Eysteries S. , 'Gene expression profiling of colon cancer by DNA microarrays and correlation with histoclinical parameters ' (2004 ) 23 Oncogene : 1377 -1391.

    • Search Google Scholar
  • Giannini, G., Rinaldi, C., Ristori, E. és mtsai: Mutations of an intronic repeat induce impaired MRE11 expression in primary human cancer with microsatellite instability. Oncogene, 2004, 23 , 2640–2647.

    Ristori E. , 'Mutations of an intronic repeat induce impaired MRE11 expression in primary human cancer with microsatellite instability ' (2004 ) 23 Oncogene : 2640 -2647.

    • Search Google Scholar
  • Giannini, G., Ristori, E., Cerignoli, F. és mtsai: Human MRE11 is inactivated in mismatch repair-deficient cancers. EMBO Rep., 2002, 3 , 248–254.

    Cerignoli F. , 'Human MRE11 is inactivated in mismatch repair-deficient cancers ' (2002 ) 3 EMBO Rep. : 248 -254.

    • Search Google Scholar
  • Belluco, C., Mammano, E., Petricoin, E. és mtsai: Kinase substrate protein microarray analysis of human colon cancer and hepatic metastasis. Clin. Chim. Acta, 2005, 357 , 180–183.

    Petricoin E. , 'Kinase substrate protein microarray analysis of human colon cancer and hepatic metastasis ' (2005 ) 357 Clin. Chim. Acta : 180 -183.

    • Search Google Scholar
  • Yoshio, T., Morita, T., Kimura, Y. és mtsai: Caldesmon suppresses cancer cell invasion by regulating podosome/invadopodium formation. FEBS Lett., 2007, 581 , 3777–3782.

    Kimura Y. , 'Caldesmon suppresses cancer cell invasion by regulating podosome/invadopodium formation ' (2007 ) 581 FEBS Lett. : 3777 -3782.

    • Search Google Scholar